במקרים מסוימים, כאשר מזהים ממצא ב-CT חזה, הרופא המטפל (בדרך כלל רופא ריאות) יפנה לביצוע ביופסיה בהנחיית CT. הממצא יתואר כ"גוש", "תהליך תופס מקום", "שאת", "הצללה", תסנין", "קשרית" או "קונסולידציה" - תיאורים אשר מצביעים על  מבנה שאינו תקין בבית החזה.

ה-CT הוא מכשיר הדמיה אשר במקרה זה מסייע לרופא להגיע אל הממצא בריאות, ובעזרת מחט יילקחו מספר דגימות לשם קביעת האבחנה.

הבדיקה נעשית ביחידת הרנטגן / אגף דימות בחדר בו נמצא מכשיר CT. הבדיקה נעשית כאשר הנבדק שוכב על הבטן, על הצד או על הגב, לפי מיקום הנגע. הרופא יזריק חומר לאלחוש מקומי, בנקודה שממקמת אותו באזור הממצא.

בדיקה זו מסייעת לרופאים בקביעת האבחנה ומתוך כך בחירת הטיפול המתאים. הדגימות יישלחו למעבדה ותוך כעשרה ימים תתקבלנה תוצאות אשר יישלחו לרופא המפנה לבדיקה.

הכנה לבדיקה כוללת הפסקת תרופה לדילול הדם כמו אספירין או קומדין בהנחיית הרופא המטפל, ובהתייעצות עם הרופא המבצע, וכן צום במשך שעתיים טרם הבדיקה. משך הבדיקה הוא כ-20 דקות.

לאחר הבדיקה יישאר המטופל בהשגחה לעוד כשעתיים וייתכן שיתבקש לבצע צילום חזה ביקורת לפני שחרור. הסיבוכים הנדירים כוללים דמם וחזה אוויר.